rstatixパッケージを用いて解析を行います。
以下にサンプルデータを示します。このデータは1列目にグループ、2列目に値をとっています。valuesは握力とします。この2つのグループの握力の平均値に有意な差が有るのかを対応のないt検定（Welch）で検証してみます。
groups | values |
a | 32.1 |
a | 29.5 |
a | 34.8 |
中略 | 中略 |
b | 35.2 |
b | 36.4 |
b | 35.1 |
中略 | 中略 |
上記のデータの名前はdata1としています。
rstatixパッケージを読み込んでt検定のコードを入力していきます。
> library(rstatix) 次のパッケージを付け加えます: ‘rstatix’ 以下のオブジェクトは ‘package:stats’ からマスクされています: filter > t_test(data = data1, values ~ groups, paired = FALSE) # A tibble: 1 × 8 .y. group1 group2 n1 n2 statistic df p * <chr> <chr> <chr> <int> <int> <dbl> <dbl> <dbl> 1 values a b 20 20 -5.35 25.9 0.0000133
このコードでは、t_test関数を( )内の内容にしたがって実行しています。( )内では、データの指定と対応の有り無しの指定を行います。最初にデータの指定です。ここでは、data1です。valuesとgroupsを ~ で結んでおり、valuesの値についてgroupsで分けて分析するという意味になります。対応の有無は、paired=で指定します。TRUEとすれば対応あり、FALSEとすれば対応なし、となります。なお、t_test関数の対応のないt検定では、指定しない限り等分散を仮定しないWelchのt検定が実行されます。もし、等分散を仮定したStudentのt検定を実行したい場合は、var.equal = TRUEを( )内に加えると実行できます。
n1とn2は各グループのサンプルサイズ、statisticはt値、dfが自由度、pがp値になります。有意水準を5%と設定した場合、帰無仮説は棄却されるため、2つのグループに有意な差があると結論づけることができます。
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