再掲 Rで反復測定一元配置分散分析（多変量分散分析と自由度調整法）one way repeated measures MANOVA using car package

Rで反復測定一元配置分散分析を再掲。
反復測定のANOVAでは球面性の仮定が厄介なので、球面性の仮定が不要なMANOVA（多変量分散分析）が便利だと個人的には思う。
car パッケージが最適で、MANOVAの他にも自由度調整法のANOVAの結果も返してくれる。なお、統計量としては、いつもPillaiのトレースを使っている。

なお、今回の解析では…あるテストを40人に対して3回実施したもの（実際には人工的に作ったデータ）を分散分析にかけてみた。
エクセルで3列にして40人分の点数のデータを作っておく。そして以下のコードを実行。
手効果があれば多重比較へGO。